Противоречия никакого нет. Останавливают не мысли, а мышление, для того, чтобы не мешали лишние мысли, когда они не нужны. Но это не означает, что мысли и сам ум не будут нужны уже никогда. Ментальный аппарат действует на разных планах человеческого существа - и на физическом, и на витальном, и на собственно ментальном. Распознаются абсолютно все предметы при помощи ментальных образов, запечатлённых в памяти. Любые действия физического тела происходят потому, что в памяти тела хранится образ - программа движений, которая включается при необходимости волевым импульсом сознания. Это происходит очень быстро и поэтому обычно не замечается. В витальном теле так же существует свой ум. Он более обширный, чем в физическом теле, но гораздо примитивнее того ума, который мы развиваем при обучении в школе или ВУЗе.
Ум позволяет нам правильно строить план действий, формулировать свои мысли, воспринимать текст или язык жестов. Существует два вида ума: обычный ментал - внешний ум, и Истинный ментал - часть внутреннего истинного существа. Это своеобразная проекция Дживатмана в области головы, но она занимается самыми важными вещами с позиции нравственности и ещё служит проводником истинных знаний. Но для того, чтобы иметь возможность воспринимать эти знания, человек должен обладать соответствующим уровнем подготовки, чтобы переводить знания непосредственно в слова, т.е. быть достаточно духовно развитым.